More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002900 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
131 aa  268  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  85.5 
 
 
131 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.79 
 
 
135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  53.44 
 
 
131 aa  146  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.31 
 
 
131 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  51.54 
 
 
131 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.2 
 
 
131 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  52.67 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.15 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.38 
 
 
131 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  51.54 
 
 
131 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 
149 aa  140  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.23 
 
 
131 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  50.77 
 
 
131 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.13 
 
 
133 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.08 
 
 
131 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  48.85 
 
 
132 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.85 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.46 
 
 
131 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  51.3 
 
 
121 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.56 
 
 
132 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.31 
 
 
131 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.38 
 
 
131 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.31 
 
 
131 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  48.41 
 
 
126 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  48.41 
 
 
126 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  44.72 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  44.62 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  43.08 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.64 
 
 
126 aa  95.1  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  42.31 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  40.8 
 
 
126 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  42.31 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  44.19 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  40.77 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  42.42 
 
 
238 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  41.67 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  41.04 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  41.67 
 
 
130 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  39.23 
 
 
129 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  38.64 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  40.15 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  38.89 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  40 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  39.23 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2733  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  40.62 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02261  putative lactoylglutathione lyase  41.04 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0600753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2094  glyoxalase I  41.54 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2706  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  39.71 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2432  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 
264 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  41.86 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  37.59 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  39.84 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  37.4 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  38.46 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  36.3 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  39.69 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  38.17 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  39.23 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  38.46 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  36.84 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  38.52 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  38.93 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  36.84 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  35.29 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  34.56 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  34.33 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  37.5 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  34.33 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>