272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2289 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
131 aa  263  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  67.18 
 
 
131 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  66.41 
 
 
131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  63.36 
 
 
131 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.36 
 
 
131 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.36 
 
 
131 aa  174  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.54 
 
 
131 aa  170  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.49 
 
 
131 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.62 
 
 
131 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  56.92 
 
 
131 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.15 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  56.92 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.25 
 
 
131 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
131 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.44 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.62 
 
 
131 aa  143  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.38 
 
 
131 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
131 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.06 
 
 
133 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.62 
 
 
131 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.62 
 
 
131 aa  139  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  57.5 
 
 
121 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.46 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.48 
 
 
132 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  47.73 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  48.46 
 
 
131 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  48.46 
 
 
131 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.97 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  50 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 
131 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  46.03 
 
 
126 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  40.48 
 
 
126 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  40.48 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.94 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  42.52 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  46.72 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.52 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  39.1 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  41.86 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  40.31 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.28 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  38.58 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  40.62 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  39.37 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  39.37 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  39.06 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  38.28 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.58 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0247  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  35.88 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  37.01 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  34.35 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  39.06 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  35.66 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  35.61 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  37.01 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  35.38 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  37.5 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  39.52 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  36.09 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  35.71 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  35.38 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  33.07 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  34.92 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  35.56 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  35.07 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3401  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356805  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  33.85 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  35.56 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>