29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1338 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  666    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  54.84 
 
 
345 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  52.35 
 
 
341 aa  345  6e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  54.23 
 
 
338 aa  344  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  53.91 
 
 
340 aa  342  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  51.45 
 
 
340 aa  339  4e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  52.59 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  65.28 
 
 
263 aa  332  6e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  52.2 
 
 
336 aa  329  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  51.16 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  50.73 
 
 
339 aa  323  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  51.32 
 
 
347 aa  318  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  50.58 
 
 
334 aa  316  3e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  52.05 
 
 
336 aa  311  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  48.68 
 
 
336 aa  297  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  46.13 
 
 
335 aa  288  7e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  52.4 
 
 
256 aa  226  6e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  34.97 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  33.72 
 
 
364 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  32.42 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  32.74 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  31.18 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0466  hypothetical protein  44.83 
 
 
165 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  51.75 
 
 
118 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  36 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0945  hypothetical protein  57.89 
 
 
69 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  44.3 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0875  hypothetical protein  57.45 
 
 
80 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0521  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>