24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1298 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  737    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  78.71 
 
 
387 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  32.86 
 
 
339 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  33.72 
 
 
341 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  32.29 
 
 
333 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  32.69 
 
 
338 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  32.29 
 
 
340 aa  143  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  31.62 
 
 
340 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  33.14 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  31.07 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  29.86 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  30.95 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  29.75 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  33.45 
 
 
263 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  31.83 
 
 
334 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  29.46 
 
 
340 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  29.83 
 
 
339 aa  123  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  25.99 
 
 
341 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  28.69 
 
 
347 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  29.72 
 
 
336 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  38.59 
 
 
256 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  26.33 
 
 
335 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  37.11 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  34.75 
 
 
118 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>