25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1542 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  78.71 
 
 
364 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  34.97 
 
 
341 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  32.29 
 
 
339 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  34.38 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  33.43 
 
 
338 aa  149  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  32.67 
 
 
340 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  31.32 
 
 
333 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  33.98 
 
 
336 aa  144  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  31.62 
 
 
338 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  32.39 
 
 
345 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  31.84 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  29.69 
 
 
340 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  29.91 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  34.05 
 
 
263 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  26.09 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  31.46 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  29.43 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  31.86 
 
 
334 aa  119  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  31.05 
 
 
336 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  27.97 
 
 
335 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  36.71 
 
 
156 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  42.24 
 
 
118 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
1070 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>