28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0469 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  681    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  79.12 
 
 
340 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  65.29 
 
 
340 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  76.6 
 
 
263 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  51.33 
 
 
338 aa  345  6e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  53.87 
 
 
334 aa  342  7e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  49.85 
 
 
341 aa  335  7e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  49.56 
 
 
340 aa  328  6e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  51.8 
 
 
341 aa  322  6e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  51.2 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  51.92 
 
 
336 aa  306  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  49.85 
 
 
339 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  49.55 
 
 
335 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  46.69 
 
 
345 aa  292  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  50 
 
 
336 aa  288  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  52.09 
 
 
256 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0466  hypothetical protein  59.57 
 
 
165 aa  159  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  33.43 
 
 
387 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  32.69 
 
 
364 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  31.36 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  34.08 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  30.94 
 
 
333 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  55.75 
 
 
118 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  36.65 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0875  hypothetical protein  57.45 
 
 
80 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  26.56 
 
 
685 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 
663 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>