26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1344 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  100 
 
 
339 aa  682    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  32.86 
 
 
364 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  32.29 
 
 
387 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  34.11 
 
 
341 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  32.05 
 
 
333 aa  146  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  31.36 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  33.72 
 
 
338 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  31.96 
 
 
329 aa  132  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  28.77 
 
 
339 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  30.7 
 
 
340 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  30.14 
 
 
347 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  28.49 
 
 
345 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  33.12 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  31.59 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  29.39 
 
 
340 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  29.83 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  28.16 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  28.36 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  29.58 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  33.46 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  30.84 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  34.27 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1781  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0466  hypothetical protein  32.19 
 
 
165 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  33.72 
 
 
118 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>