21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0466 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0466  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  5e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  65.71 
 
 
340 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  59.57 
 
 
338 aa  173  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  59.57 
 
 
340 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  47.59 
 
 
341 aa  123  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  48.28 
 
 
347 aa  120  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  47.89 
 
 
339 aa  120  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  45.14 
 
 
340 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  43.84 
 
 
334 aa  114  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  45.71 
 
 
338 aa  110  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  43.97 
 
 
341 aa  110  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  44.29 
 
 
336 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  42.96 
 
 
335 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  41.84 
 
 
336 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  43.57 
 
 
345 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  39.33 
 
 
263 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  34.04 
 
 
339 aa  58.9  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  47.14 
 
 
256 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  26.95 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  28.99 
 
 
333 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>