25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0467 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0467  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  231  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0901  hypothetical protein  73.68 
 
 
340 aa  167  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0902  hypothetical protein  54.31 
 
 
340 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1433  hypothetical protein  50.86 
 
 
340 aa  114  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000014785  decreased coverage  0.00000326211 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1381  AAA ATPase  47.5 
 
 
345 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0259377  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1439  hypothetical protein  50.44 
 
 
338 aa  110  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000356058  hitchhiker  0.00000829361 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1338  hypothetical protein  51.75 
 
 
341 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1422  hypothetical protein  50.43 
 
 
335 aa  107  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.653598  normal  0.0170748 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1436  hypothetical protein  47.32 
 
 
341 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000012396  decreased coverage  0.00000304968 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0469  hypothetical protein  55.75 
 
 
338 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0897  hypothetical protein  50.44 
 
 
263 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2204  hypothetical protein  48.28 
 
 
336 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0382  hypothetical protein  43.48 
 
 
339 aa  92  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0333  hypothetical protein  48.25 
 
 
336 aa  89.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0851  hypothetical protein  46.02 
 
 
256 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0223679  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0134  hypothetical protein  48.25 
 
 
336 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0336  hypothetical protein  50 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.764607  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1029  hypothetical protein  43.36 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36432  normal  0.224634 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1542  hypothetical protein  42.24 
 
 
387 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1298  hypothetical protein  34.75 
 
 
364 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110828 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1782  hypothetical protein  30.09 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0120  AAA ATPase  33.67 
 
 
329 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00551833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0875  hypothetical protein  56.25 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0796  hypothetical protein  31.48 
 
 
333 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1344  ATPase  33.72 
 
 
339 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>