36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03897 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03515  hypothetical protein  40.77 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  41.12 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.106886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  36.04 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  31.47 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  34.23 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  31.9 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  30.3 
 
 
340 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  30.06 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  41.27 
 
 
298 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  43.06 
 
 
267 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  43.06 
 
 
267 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  43.06 
 
 
267 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  28.79 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3483  hypothetical protein  29.32 
 
 
282 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0228033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2168  hypothetical protein  30.85 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  26.92 
 
 
293 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  27.13 
 
 
283 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  41.54 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  26.92 
 
 
464 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  28.26 
 
 
307 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>