31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0411 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  78.03 
 
 
346 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  78.03 
 
 
346 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  76.3 
 
 
346 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  28.52 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  25.86 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  25.69 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  25.38 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  30.3 
 
 
167 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  30.3 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  30.3 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  30.3 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  30.3 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  29.55 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04711  hypothetical protein  25.71 
 
 
271 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  27.84 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  27.84 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  27.84 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_003296  RS01954  hypothetical protein  26.27 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.091836  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  28.79 
 
 
169 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  38.18 
 
 
168 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  28.03 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2341  hypothetical protein  28.79 
 
 
168 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  28.79 
 
 
169 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  28.03 
 
 
168 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  26.12 
 
 
167 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>