12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01954 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01954  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.091836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  30.05 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2692  hypothetical protein  30.54 
 
 		 338 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2205  hypothetical protein  29.77 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6439  hypothetical protein  30.16 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.450105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1282  hypothetical protein  28.64 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  26.27 
 
 		 340 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  26.97 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01957  hypothetical protein  27.34 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  25.62 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  25.62 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  24.88 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>