25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1507 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  47.56 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  45.49 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  35.56 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  26.94 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  27.6 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  27.6 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  25.87 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  25.87 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  25.69 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  25.67 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  28.16 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02030  hypothetical protein  29.82 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  25.73 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  31.43 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  26.45 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  28.49 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  28.49 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  28.49 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  26.39 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  26.39 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03515  hypothetical protein  34.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  26.39 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>