27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4616 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  99.63 
 
 
267 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  34.86 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  32.08 
 
 
294 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  28.5 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2205  hypothetical protein  31.48 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673181  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0064  hypothetical protein  33.93 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3480  hypothetical protein  28.18 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0884428  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2692  hypothetical protein  26.13 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  31.98 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6439  hypothetical protein  30.43 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.450105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1282  hypothetical protein  27.03 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00271  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00501  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  43.06 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01368  hypothetical protein  27.57 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  27.84 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  26.04 
 
 
346 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  26.21 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  26.21 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  26.21 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3915  hypothetical protein  29.59 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206189  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  28.49 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  26.9 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  26.9 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>