14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0210 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  53.9 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  47.56 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  34.2 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  26.74 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  25.41 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  23.41 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  23.41 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  25.39 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  25.67 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02030  hypothetical protein  26.8 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  24.83 
 
 		 175 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  22.93 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  26.14 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.106886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>