30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  31.13 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.106886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  31.43 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  30.66 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  30.66 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  24.83 
 
 		 295 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  33.85 
 
 		 294 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  31.19 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  29.09 
 
 		 349 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  24.49 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  32.71 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  33.64 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  29.05 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  26.57 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03515  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  31.88 
 
 		 340 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  28.74 
 
 		 296 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  32.71 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  32.71 
 
 		 313 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>