29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3850 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  24.03 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  34.31 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  28.19 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  28.19 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  28.19 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2537  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  29.36 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  24.06 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  25.7 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  23.99 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  30.25 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3034  hypothetical protein  27.69 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1217  hypothetical protein  26.15 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4489  hypothetical protein  24.36 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  28.3 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  35.92 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  28.3 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0629  hypothetical protein  24.87 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  24.49 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1184  hypothetical protein  22.63 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0700  hypothetical protein  27.5 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2509  hypothetical protein  25.6 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  31.48 
 
 		 167 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  27.13 
 
 		 158 aa  42.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>