36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5072 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.106886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  41.55 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  40.15 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  38.41 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  37.68 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  37.76 
 
 		 313 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  37.68 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  36.96 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2341  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  38.41 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  41.12 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03515  hypothetical protein  32.23 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  29.32 
 
 		 307 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  33.81 
 
 		 349 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  26.14 
 
 		 295 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  31.03 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  38.82 
 
 		 464 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  38.82 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  25.95 
 
 		 296 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  34.92 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  41.94 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  31.78 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04688  hypothetical protein  29.63 
 
 		 278 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  27.61 
 
 		 285 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21460  hypothetical protein  29.51 
 
 		 271 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0237  hypothetical protein  32.76 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  29.91 
 
 		 270 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>