24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3453 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  93.33 
 
 		 270 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3034  hypothetical protein  30.47 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  26.74 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1217  hypothetical protein  30.47 
 
 		 177 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  28.16 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  30.25 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0700  hypothetical protein  32.65 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  25.39 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  42.62 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  34.35 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4489  hypothetical protein  32.84 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  28.89 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1184  hypothetical protein  29.58 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  25.58 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242698  normal  0.16466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  28.46 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0237  hypothetical protein  28.3 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  22.58 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  28.07 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1027  hypothetical protein  30.15 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  27.01 
 
 		 299 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>