25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2187 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  93.33 
 
 		 270 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3034  hypothetical protein  32.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  27.17 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  25.67 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0700  hypothetical protein  31.97 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  24.61 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  40.58 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  35.92 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  32.82 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  28.89 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  24.26 
 
 		 421 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  31.62 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1184  hypothetical protein  24.79 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3045  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242698  normal  0.16466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4489  hypothetical protein  31.16 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  28.79 
 
 		 158 aa  45.4  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  26.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0237  hypothetical protein  26.42 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  27.01 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>