21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  51.67 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  52.94 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0455  hypothetical protein  45.18 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  43.17 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3045  hypothetical protein  63.64 
 
 		 97 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242698  normal  0.16466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  36.94 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1184  hypothetical protein  26.23 
 
 		 432 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  28 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  32.21 
 
 		 169 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  32.21 
 
 		 169 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0700  hypothetical protein  28.46 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  25.99 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  28.09 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  31.19 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3034  hypothetical protein  28.17 
 
 		 177 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>