17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2564 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  31.72 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  32.59 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  33.48 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  36.96 
 
 		 421 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0455  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3045  hypothetical protein  46.67 
 
 		 97 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242698  normal  0.16466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  28.19 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0819  hypothetical protein  26.52 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1184  hypothetical protein  23 
 
 		 432 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  26.21 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1217  hypothetical protein  22.44 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  25.86 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  23.74 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3034  hypothetical protein  23.03 
 
 		 177 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>