31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1846 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  83.83 
 
 
167 aa  289  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  82.63 
 
 
167 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  59.88 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  59.28 
 
 
169 aa  214  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2341  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  208  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  59.28 
 
 
169 aa  208  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  58.68 
 
 
168 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  59.28 
 
 
168 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  58.68 
 
 
313 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  59.28 
 
 
167 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  59.28 
 
 
313 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.106886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  33.04 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03515  hypothetical protein  30.36 
 
 
134 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  33.75 
 
 
298 aa  54.3  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  29.25 
 
 
349 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21460  hypothetical protein  25.45 
 
 
271 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  29.89 
 
 
294 aa  47.8  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  25.99 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  26.57 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0839  hypothetical protein  36.89 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  31.48 
 
 
283 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0237  hypothetical protein  32.14 
 
 
200 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  25.85 
 
 
346 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  25.85 
 
 
346 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  24.63 
 
 
340 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>