27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2629 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  78.9 
 
 
346 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  78.03 
 
 
340 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  26.73 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  27.6 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  31.38 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  30.67 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  27.14 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  27.14 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  30.66 
 
 
175 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  26.67 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  35.09 
 
 
167 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  26.9 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  26.9 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  26.9 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01954  hypothetical protein  25.62 
 
 
212 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.091836  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  23.41 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  20.74 
 
 
296 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04711  hypothetical protein  25.24 
 
 
271 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>