19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1616 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  99.66 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02055  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01529  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.736579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  35.64 
 
 
295 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  25.83 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0064  hypothetical protein  28.05 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  28.65 
 
 
298 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  28.16 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3915  hypothetical protein  26.4 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206189  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  28.85 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  26.21 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  26.21 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  26.21 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0416  hypothetical protein  29.33 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0389  hypothetical protein  31.75 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  26.39 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7021  hypothetical protein  25.48 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>