35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2928 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  100 
 
 		 557 aa  1134    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  31.67 
 
 		 548 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  31.44 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  26.13 
 
 		 546 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  27.75 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  38.96 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  38.96 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  36.96 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  40.28 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  40.28 
 
 		 487 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  40.28 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  40.28 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  58.7 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  59.57 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  40.32 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  40.32 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  40.32 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  38.71 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  55.1 
 
 		 901 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  50 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 475 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1394  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.62 
 
 		 715 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.841364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  41.3 
 
 		 909 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  41.3 
 
 		 909 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  37.1 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>