32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0670 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  96.69 
 
 		 483 aa  968    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  97.1 
 
 		 483 aa  972    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  996    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  96.31 
 
 		 379 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  96.69 
 
 		 483 aa  968    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  96.69 
 
 		 483 aa  969    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  53.85 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  53.52 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  53.32 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  53.32 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  49.69 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  52.69 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.49 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  51.26 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  51.49 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  44.05 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  44.26 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  43.63 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  43.84 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  30.42 
 
 		 909 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  30.61 
 
 		 909 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 901 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  43.4 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  43.4 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 678 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  41.27 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  29.2 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  33.33 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  46 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  34.92 
 
 		 570 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>