34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1885 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
901 aa  1806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  29.18 
 
 
909 aa  273  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  28.83 
 
 
909 aa  273  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  32.1 
 
 
477 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  35.42 
 
 
477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  35.11 
 
 
477 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  31.41 
 
 
477 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  34.6 
 
 
483 aa  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.6 
 
 
483 aa  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  33.61 
 
 
490 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  33.33 
 
 
487 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  33.33 
 
 
490 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
490 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  33.97 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  33.65 
 
 
483 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  31.55 
 
 
475 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.726449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  32.41 
 
 
475 aa  145  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.41 
 
 
475 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
483 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  32.1 
 
 
475 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  31.55 
 
 
475 aa  141  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  27.4 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  58.49 
 
 
678 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  41.43 
 
 
426 aa  62  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  41.43 
 
 
426 aa  62  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  49.06 
 
 
426 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  41.98 
 
 
557 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  35.48 
 
 
548 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  37.23 
 
 
546 aa  52  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  27.45 
 
 
568 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  56.52 
 
 
621 aa  48.5  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  48.98 
 
 
569 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  41.94 
 
 
515 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1394  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.48 
 
 
715 aa  45.8  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.841364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>