32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2996 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
483 aa  993    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  97.72 
 
 
483 aa  973    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  96.69 
 
 
483 aa  968    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  98.42 
 
 
379 aa  771    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
483 aa  993    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  97.72 
 
 
483 aa  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  54.66 
 
 
487 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  54.73 
 
 
490 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  54.33 
 
 
490 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  54.53 
 
 
490 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  50.1 
 
 
475 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  49.69 
 
 
475 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.28 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  49.07 
 
 
475 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.726449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  49.28 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  45.09 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  45.09 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  44.47 
 
 
477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 
477 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  31.5 
 
 
909 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  30.42 
 
 
909 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  34.6 
 
 
901 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  43.4 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  43.4 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
678 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  41.27 
 
 
546 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  39.34 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  33.33 
 
 
557 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  46 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  34.92 
 
 
570 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 
548 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>