35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0667 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  96.21 
 
 
475 aa  893    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.726449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  96 
 
 
475 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
475 aa  978    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  96 
 
 
475 aa  894    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  97.68 
 
 
475 aa  908    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  49.9 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.9 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  49.07 
 
 
483 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  49.48 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  49.69 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  45.58 
 
 
490 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  45.58 
 
 
490 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  45.98 
 
 
490 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  45.45 
 
 
487 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  47.19 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  47.4 
 
 
477 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  46.14 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  46.15 
 
 
477 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  45.65 
 
 
379 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  32.62 
 
 
909 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  31.01 
 
 
909 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  31.37 
 
 
901 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  37.65 
 
 
426 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  37.65 
 
 
426 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  41.89 
 
 
570 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 
426 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  48.33 
 
 
678 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  50 
 
 
557 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  42.86 
 
 
515 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
548 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  45.28 
 
 
546 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  42.62 
 
 
621 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  43.14 
 
 
569 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  43.4 
 
 
568 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1394  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
715 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.841364 
 
 
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