175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2504 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 678 aa  1400    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  25.07 
 
 		 426 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  25.07 
 
 		 426 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 426 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1394  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.12 
 
 		 715 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.841364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1094 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  58.49 
 
 		 901 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.06 
 
 		 1694 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  27.85 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.05 
 
 		 832 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1276 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 		 1486 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.42 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 878 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.51 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 361 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.4 
 
 		 292 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  54 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 		 784 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  54.35 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 391 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  54.35 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  50 
 
 		 557 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  54.35 
 
 		 490 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.17 
 
 		 810 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.51 
 
 		 733 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  54.35 
 
 		 490 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 934 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 3035 aa  55.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 750 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 293 aa  54.3  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 4079 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0428  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 246 aa  54.3  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.562836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.27 
 
 		 706 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  28.06 
 
 		 375 aa  54.3  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 291 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  23.1 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 1421 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 3560 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.1 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  50 
 
 		 477 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 425 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  48.28 
 
 		 475 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 332 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  50 
 
 		 477 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 477 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 617 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  48.28 
 
 		 475 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.92 
 
 		 1007 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.18 
 
 		 668 aa  52.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 1737 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 		 475 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  23.1 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 		 475 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  44.07 
 
 		 477 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  51.6  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 572 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 292 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  47.92 
 
 		 483 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  22.38 
 
 		 483 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  43.4 
 
 		 546 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 452 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.71 
 
 		 887 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.42 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1827 aa  51.2  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 836 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 292 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 605 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.37 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 279 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1276 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 713 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1676 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1297 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  31.45 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 		 3301 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 314 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 371 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 		 261 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 356 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  27.33 
 
 		 791 aa  48.9  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>