33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4189 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  83.06 
 
 		 909 aa  1565    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 909 aa  1875    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  27.91 
 
 		 901 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  33.13 
 
 		 475 aa  168  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  32.67 
 
 		 490 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.13 
 
 		 475 aa  168  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  33.03 
 
 		 475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  32.39 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  32.39 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  32.62 
 
 		 475 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  32.39 
 
 		 487 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  29.69 
 
 		 477 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  31.43 
 
 		 475 aa  166  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  30.73 
 
 		 477 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  30.35 
 
 		 477 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.5 
 
 		 483 aa  154  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  31.5 
 
 		 483 aa  154  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  30.97 
 
 		 483 aa  154  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  29.1 
 
 		 477 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  30.42 
 
 		 483 aa  153  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  31.23 
 
 		 483 aa  151  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  33.88 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  26.82 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  33.88 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 426 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  34.34 
 
 		 569 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1394  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 		 715 aa  49.3  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.841364 
 
 
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NC_013202  Hmuk_1805  heat shock protein DnaJ domain protein  40.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.274411 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  41.3 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  41.3 
 
 		 548 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 		 568 aa  45.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS00401  hypothetical protein  46.51 
 
 		 621 aa  44.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
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