30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4770 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 		 570 aa  1154    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  31.32 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  29.65 
 
 		 515 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2928  DnaJ domain protein  31.44 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0540178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  24.95 
 
 		 548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  39.22 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  60.42 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  41.89 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  41.89 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  41.89 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  41.89 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.89 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  59.57 
 
 		 621 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  39.62 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  39.62 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  40.62 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  40.62 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  40.62 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  40.62 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  44.68 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3023  heat shock protein DnaJ domain protein  35.09 
 
 		 499 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.197808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  34.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 		 477 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  34.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  44.68 
 
 		 477 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>