26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2845 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  317  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  45.14 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  43.33 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  43.45 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  45.89 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  44.88 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  43.51 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  42.52 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  42.52 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  36.72 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  30.89 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  31.15 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2524  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  31.78 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>