23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4893 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  79.72 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  93.71 
 
 		 143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  93.71 
 
 		 143 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  54.79 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  52.78 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  48.65 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  40.88 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  34.29 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  28.8 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  29.6 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  29.6 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  29.13 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  27.21 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  27.46 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>