20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4715 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  97.9 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  93.71 
 
 		 143 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  74.83 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  55.15 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  50.35 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  42.77 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  43.55 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  40.54 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  35.88 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  32.77 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  30.12 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  28.06 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>