34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3807 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  69.67 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  72.95 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  72.95 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  72.95 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2175  hypothetical protein  77.05 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  52.55 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  49.24 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  48.48 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  37.29 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4627  hypothetical protein  33.59 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.731914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  41.25 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  35.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  28.86 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  34.96 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  27.66 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  29.84 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  28.46 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1920  hypothetical protein  25.16 
 
 		 165 aa  40  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.609778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>