24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4629 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  79.72 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  76.22 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  74.83 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  51.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  51.77 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  47.97 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  45.14 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  32.28 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  29.37 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  29.84 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  32.93 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  32.93 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  32.93 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  25.85 
 
 		 142 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  33.59 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  29.76 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  28.35 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>