20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4423 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  84.03 
 
 		 144 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  51.77 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  51.41 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  51.06 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  51.06 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  45.71 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  41.51 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  41.78 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  45.89 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  34.41 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  37.96 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  30.66 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4627  hypothetical protein  31.21 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.731914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  35.61 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  34.91 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>