20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4837 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4837  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  289  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510125  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4715  hypothetical protein  97.9 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  93.71 
 
 		 143 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  76.22 
 
 		 143 aa  224  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  54.61 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  50.35 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  43.4 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  43.55 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  41.72 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  38.93 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>