14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2982 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1841  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.485932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  32.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  29.53 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  33.66 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  29.01 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2524  hypothetical protein  28.17 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  25.5 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>