19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2829 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2524  hypothetical protein  75.62 
 
 
150 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  27.95 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  31.06 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  26.95 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  28.38 
 
 
154 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  29.56 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  28.83 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  33.62 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  32.5 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  29.69 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  31.87 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  30.49 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  30.63 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  30.63 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  29.91 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>