17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2524 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2524  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  75.62 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  27.92 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  29.71 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  27.56 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  32.71 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  27.59 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  27.78 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2982  hypothetical protein  29.29 
 
 		 148 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  28.81 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  28.16 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>