38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2175 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  78.34 
 
 
156 aa  238  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  42.18 
 
 
125 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  42.18 
 
 
125 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  43.54 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  41.5 
 
 
125 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  42.18 
 
 
125 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1324  hypothetical protein  31.33 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  36.62 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2524  hypothetical protein  29.53 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  30.67 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2453  hypothetical protein  29.33 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214056  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  30.87 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  31.47 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  32.79 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  31.06 
 
 
160 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  31.54 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  30.07 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  28.47 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1920  hypothetical protein  25.85 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.609778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15050  hypothetical protein  30.46 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  32.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2708  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  31.08 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  31.54 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  32.71 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  30.07 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  30.07 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  30.07 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  29.53 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4893  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461858  normal  0.682787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0686  putative lipoprotein  25.17 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  34.91 
 
 
143 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>