29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0040 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  245  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  48.85 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4627  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.731914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  37.19 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2175  hypothetical protein  47.95 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  38.58 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  35.25 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  35.25 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  34.43 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  35.2 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4423  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4882  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  29.53 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  30.37 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  38.27 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>