38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2508 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  248  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  97.71 
 
 
165 aa  220  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  84.73 
 
 
131 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  52.63 
 
 
122 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  51.88 
 
 
122 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  50.38 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  50.38 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  50.38 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  48.87 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2175  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103716  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  30.57 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0200  hypothetical protein  35.66 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  30.87 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  36.09 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  38.69 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  32.8 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  37.04 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  33.83 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  34.85 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  37.31 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  37.31 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2708  hypothetical protein  37.98 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1391  hypothetical protein  27.14 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  33.96 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4117  hypothetical protein  33.57 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000467794  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  29.36 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0597  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26679  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0969  hypothetical protein  32.62 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0219351  normal  0.234882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40100  hypothetical protein  26.67 
 
 
133 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>