19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3673 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4408    95.21 
 
 		 856 bp  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0371038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3673    100 
 
 		 500 bp  991    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  90.18 
 
 		 441 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4169  hypothetical protein  85.9 
 
 		 432 bp  127  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158064  normal  0.161569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  96.97 
 
 		 381 bp  107  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3674    100 
 
 		 357 bp  87.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  88.75 
 
 		 438 bp  87.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  88.75 
 
 		 438 bp  87.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  85.11 
 
 		 1290 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  85.9 
 
 		 438 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0014    93.18 
 
 		 357 bp  63.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  85.33 
 
 		 735 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  94.87 
 
 		 369 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3219  hypothetical protein  94.74 
 
 		 126 bp  60  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  91.89 
 
 		 369 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  91.89 
 
 		 369 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    100 
 
 		 754 bp  46.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    100 
 
 		 363 bp  46.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0119    91.43 
 
 		 252 bp  46.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.405208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>