12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0014 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0014    100 
 
 		 357 bp  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  91.91 
 
 		 735 bp  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  89.66 
 
 		 369 bp  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3222  hypothetical protein  92.08 
 
 		 216 bp  266  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  83.05 
 
 		 369 bp  222  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  83.05 
 
 		 369 bp  222  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3219  hypothetical protein  96.19 
 
 		 126 bp  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  91.82 
 
 		 1290 bp  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3674    88.37 
 
 		 357 bp  91.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4408    88.37 
 
 		 856 bp  91.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0371038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3673    93.18 
 
 		 500 bp  63.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  84.21 
 
 		 381 bp  56  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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