57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4169 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4169  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158064  normal  0.161569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  60.98 
 
 		 429 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  63.64 
 
 		 244 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  50.72 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  39.74 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  43.48 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  43.48 
 
 		 249 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.46 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  76.47 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  58.14 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  43.75 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  43.75 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  43.75 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  43.75 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3219  hypothetical protein  67.65 
 
 		 41 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  41.79 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  41.79 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  41.79 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  41.79 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  53.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  53.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  53.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  53.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  53.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  42.19 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  67.65 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  36.27 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  52.46 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  52.46 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  36.27 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  52.63 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  40.26 
 
 		 273 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  40.26 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  40.26 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  48.78 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  48.78 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  64.71 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  64.71 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4249  transposase, IS4 family protein  39.06 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  50 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  50 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  50 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  33.73 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  59.38 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 281 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.24 
 
 		 281 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.29 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.29 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36.63 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36.63 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.63 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36.63 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  35.8 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  35.8 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>