8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3219 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3219  hypothetical protein  100 
 
 		 41 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  92.68 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  90.24 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  90.24 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  86.49 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  80 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  88.57 
 
 		 429 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4169  hypothetical protein  67.65 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158064  normal  0.161569 
 
 
-
 
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